Job Description
»Aus Wissen wird Gesundheit« - wir füllen dieses Motto tagtäglich mit Leben, entwickeln neue Ideen und Altbewährtes weiter. Das Universitätsklinikum Frankfurt besteht seit 1914 und unsere rund 8.500 Beschäftigten bringen sich mit ihrem Können und Wissen an den 33 Fachkliniken, klinisch theoretischen Instituten und in den Verwaltungsbereichen ein. Die enge Verbindung von Krankenversorgung mit Forschung und Lehre sowie ein Klima der Kollegialität, Internationalität und berufsgruppenübergreifender Zusammenarbeit zeichnen das Universitätsklinikum aus. PhD - Machine Learning (wir richten uns mit dieser Ausschreibung an Bewerbende jeden Geschlechts) Vollzeit (100% E13) | befristet für 3 Jahre mit Option auf Verlängerung | Ausschreibungsnummer: 686-2024 Das Edinger-Institut ist eine deutsche Forschungseinrichtung und neuropathologische Diagnostikabteilung am Universitätsklinikum Frankfurt am Main. Wir sind Teil einer hervorragenden wissenschaftlichen Gemeinschaft in Frankfurt, zu der das Mildred Scheel Career Center (MSNZ), das Universitäre Centrum für Tumorerkrankungen (UCT Frankfurt-Marburg), das Deutsche Konsortium für Translationale Krebsforschung (DKTK) und das Frankfurt Cancer Institute (FCI) gehören. Die Biobank und Immunmonitoring-Plattform des FCI befindet sich im Edinger-Institut und bieten optimale Bedingungen für die gewebebasierte Forschung. ÜBER DAS PROJEKT Im Rahmen eines DFG-geförderten Forschungsprojektes soll die automatisierte Erkennung und Klassifizierung von Tumorzellen in Liquorproben mittels Deep-Learning-Modellen optimiert werden. Ziel ist es, einen vollständig digitalen Workflow und einen klinisch einsetzbaren Algorithmus zu entwickeln, um die derzeitige Praxis der manuellen Zelldifferenzierung von Liquorproben im Mikroskop grundlegend zu verändern. Die Dissertation soll auf Vorarbeiten (PMID: 36519297; https://github.com/pseegerer/csf_cell_classification ) aufbauen und mit Hilfe eines neuen, multizentrischen Datensets die Zellsegmentierung, die Erkennung von Krebszellen und die Vorhersage des Tumorursprungs zu verbessern. Ihre Aufgaben Datenvorbereitung und Training von Convolutional Neural Networks zur Verbesserung der Erkennung von Krebszellen und der Vorhersage ihres Ursprungs Vergleich und Auswahl von Zellsegmentierungsalgorithmen und deren Optimierung für Liquorproben Entwicklung interaktiver Visualisierungsmöglichkeiten und neuer Befundformate für die Diagnostik und kollaborative Forschungsprojekte Implementierung von erklärbaren KI-Methoden und Confidence Scores zur besseren Interpretierbarkeit der Klassifikationsergebnisse für diagnostische Zwecke Etablierung eines diagnostischen Workflows für die Deep Learning basierte Analyse von Liquorzellen für eine einjährige klinische Evaluationsphase parallel zur Routinediagnostik Veröffentlichung der Ergebnisse in wissenschaftlichen Zeitschriften Präsentation und Diskussion der Forschungsergebnisse auf Konferenzen im In- und Ausland Ihr Profil Masterabschluss in einem verwandten Fachgebiet wie Bioinformatik, Informatik oder Physik erworben und streben eine publikationsbasierte Promotion an Nachgewiesene Programmiererfahrung in Sprachen wie Python, R oder C++, Frameworks wie PyTorch, TensorFlow oder NumPy und Versionskontrollsystemen wie Git ·Hervorragende Kommunikationsfähigkeiten und die Fähigkeit zur Zusammenarbeit Sehr gute Englischkenntnisse und gute Deutschkenntnisse (mindestens B2) Aufgrund gesetzlicher Bestimmungen ist ein gültiger Nachweis der Masernimmunität / Masernschutzimpfung notwendig. Unser Angebot Arbeitsumfeld: Arbeiten in einem interdisziplinären jungen Forschungsteam. Tarifvertrag: Attraktives Gehalt nach Tarifvertrag, Jahressonderzahlung, 40 Sunden/Woche, 30 Tage Urlaub, betriebliche Altersvorsorge. Mobilität: Kostenloses Landesticket Hessen. Neubau : neueste Räume, neueste Technik, neueste Ausstattung und optimale Zusammenarbeit durch räumliche Zusammenfassung der Disziplinen rund um »Kopf und Herz«. Hier erhalten Sie einen ersten Einblick in unseren Neubau , eines der größten Neubauprojekte des Landes Hessens. Campus: Weitläufiger Uniklinik-Campus, moderne Mensa, verschiedene Cafés, schöne Aufenthaltsmöglichkeiten im Grünen. Work-Life-Balance: Teilzeit ist möglich, Kitaplätze direkt am Campus (für mehr Infos wenden Sie sich gerne an den UKF-Familienservice) sowie Ferienbetreuung für die Kleinen. Gesundheitsförderung: Rund um Ernährung, Entspannung, Sport und Bewegung gibt es zahlreiche Angebote, zudem 10 Stunden extra als Gesundheitszeit. Fragen? Viele Antworten gibt es in unseren FAQ´s für neue Beschäftigte. Für weitere Fragen stehen wir gerne zur Verfügung. Frauen sind in diesen Positionen am Universitätsklinikum Frankfurt unterrepräsentiert. Daher sind Bewerbungen von Frauen besonders willkommen. Schwerbehinderte Bewerbende werden bei gleicher persönlicher und fachlicher Eignung bevorzugt berücksichtigt. Werden Sie ein Teil unseres Teams! Nutzen Sie die Zeit bis zum 30.09.2024, um sich zu bewerben, bitte mit Angabe der Ausschreibungsnummer, eines möglichen Startzeitpunktes und Ihrer Gehaltsvorstellung. Für weitere Informationen steht Ihnen PD Dr. Leonille Schweizer unter 069 / 6301 84169 oder
[email protected] gerne zur Verfügung. Online bewerben Universitätsmedizin Frankfurt | Recruiting Team | Theodor-Stern-Kai 7 | 60590 Frankfurt am Main | Bitte reichen Sie Ihre Bewerbung ausschließlich über den Button »Online bewerben« ein. Rückfragen können Sie gerne an
[email protected] richten. Bitte beachten Sie, dass keine Unterlagen zurückgeschickt werden. | Folgen Sie uns auf Instagram ( @ukf_karriere ); XING , LinkedIn .
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